Přefakturace nákladů na výstavbu s různými sazbami DPH

Plné znění otázky

Společnost A hradila náklady spojené s plánovanou výstavbou velké skladovací haly (projekt, přípravné práce atd). Následně byla založena společnost B (není majetkově propojena se společností A, ale má stejného vlastníka). Samotná výstavba již probíhala pod společností B (ta měla stavební povolení), zde všechny následující faktury z výstavby - stavební práce, inženýring atd. cca v hodnotě 100 mil Kč. Na společnost A ale byly i po dobu výstavby dále některé práce fakturovány – bylo zasmluvněno, nešlo již na společnost B převést. Nyní po kolaudaci stavby bychom rádi přefakturovali náklady, které máme zaúčtované ve společnosti A na účtu 041 do společnosti B – cca 10 mil Kč. Ale teď nevíme, jak s DPH. Některé faktury byly s přenesenou DPH, některé se základní sazbou, správní poplatky osvobozené atd. Celková čistá přefakturace bez DPH asi není reálná, jelikož jsme si u odpočtových faktur DPH průběžně ve společnosti A uplatnili. Máme tedy přefakturovat to, co bylo fakturováno jednotlivými dodavateli společnosti A s přenesenou daňovou povinností také s přenesenou, a to, co s DPH, tak s DPH atd.?